pheatmap na/nan/inf聚类错误怎么解决-mile米乐体育
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2022年03月19日 21:10
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pheatmap na/nan/inf聚类错误怎么解决
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pheatmap 绘图出现报错信息类似：
error in hclust(d, method = method) : 外接函数调用时不能有na/nan/inf(arg11)
出现此类错误多数情况是数据在绘图过程中进行处理后 出现na/nan/inf导致无法进行聚类。
其一是原数据中本身存在na等情况，其二是原数据存在数据完全无变化，但pheatmap()函数中却选择了scale参数进行处理。例如其中一个基因（row）数值完全无变化，scale处理将产生nan 之后外调hclust将无法成功
>a=c(1,1,1,1,1,1,1)>scale(a)[,1][1,]nan[2,]nan[3,]nan[4,]nan[5,]nan[6,]nan[7,]nanattr(,"scaled:center")[1]1attr(,"scaled:scale")[1]0>hclust(scale(a))errorinif(is.na(n)||n>65536l)stop("sizecannotbenanorexceed65536"):missingvaluewheretrue/falseneeded
到此，相信大家对“pheatmap na/nan/inf聚类错误怎么解决”有了更深的了解，不妨来实际操作一番吧！这里是恰卡编程网网站，更多相关内容可以进入相关频道进行查询，关注mile米乐体育，继续学习！
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